Das Plugin stellt eine grafische Schnittstelle für Autojar dar. Alle zum Erzeugen eines Archivs notwendigen Optionen und Parameter können hier interaktiv über einen Wizard (Assistenten) eingegeben werden. Das Plugin fasst diese Angaben zu einer "Konfiguration" zusammen. Konfigurationen sind nicht an bestimmte Eclipse-Projekte gebunden, sondern werden außerhalb aller Projekte in der Datei autojar.config im Basisverzeichnis des Benutzers abgespeichert. Konfigurationen können beliebig erzeugt, kopiert, geändert oder gelöscht werden. Um eine Ausgabedatei neu zu erzeugen, genügt nach Auswahl der zugehörigen Konfiguration ein Klick auf "Finish".

Zur Installation des Plugins entpackt man die Datei autojar-plugin.zip im Eclipse-Installationsverzeichnis. Damit wird die Datei org.sourceforge.autojar.plugin_version in das Unterverzeichnis plugin kopiert.

Beim nächsten Start von Eclipse sollte das Plugin verfügbar sein. Falls nicht, Eclipse einmal mit dem Parameter -clean starten.

Die Eclipse-Hilfe erreicht man über das Hauptmenü: Help / Help Contents. Im Browser erscheint die Hilfeseite. Dort gibt es auf der linken Seite einen Punkt "Autojar help" mit einigen Unterpunkten. Unter "Plugin" werden, ähnlich wie hier, die Schritte zum Erstellen einer Autojar-Konfiguration beschrieben.